CelOWS: uma arquitetura orientada a serviços para definição, pesquisa e reuso de modelos biológicos

The amount of information generated by research in biological science has lead to an intensive use of models. Mathematical and computational modeling need accurate description to share, reuse and simulate models as formulated by original authors. In this paper we introduce the Cell Component Ontology CelO, an ontology expressed in OWL-DL. This ontology captures both the structure of a cell model and the properties of functional components. We are using this ontology in a Web project where the use of CelO allows describing, reasoning, querying and composing CellML models. It aims to improve reuse and composition of existent components and allow semantic validation of new models. Resumo: A quantidade e variedade de informações geradas pelas ciências biológicas têm levado a um uso intenso de modelos na área. Neste contexto, tanto a modelagem matemática quanto a modelagem computacional necessitam de uma descrição acurada que permita que esses modelos sejam compartilhados, reutilizados e simulados tal como foram formulados por seus criadores. Neste artigo, apresentamos a Cell Component Ontology CelO, uma ontologia expressa em OWL-DL, que captura tanto a estrutura do modelo de uma célula quanto as propriedades dos seus componentes funcionais. A ontologia CelO é utilizada em uma arquitetura orientada a serviços para descrever, realizar inferências e consultar os modelos CellML. O objetivo principal da arquitetura é facilitar o reuso e a composição dos componentes existentes e permitir a validação semântica de novos modelos.